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广泛分布于细菌基因组中的、强免疫刺激性CpG-ODN的发现

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第1章 综述

1.1 CpG-ODN免疫属性发现过程

1.2 CpG-ODN信号传导通路

1.2.1 TLR9依赖型信号传导途径

1.2.2 非TLR9依赖型信号传导途径

1.3 CpG-ODN结构特征

1.3.1 CpG motif

1.3.2 CpG-ODN骨架结构

1.4 CpG-ODN分类

1.4.1 根据CpG-ODN结构分类

1.4.2 根据 CpG-ODN免疫刺激 性分类

1.5 CpG-ODN种属特异性

1.6 CpG-ODN在临床上的应用

1.6.1 肿瘤治疗

1.6.2 病毒感染性疾病

1.6.3 放化疗增敏剂

1.6.4 自身免疫性疾病

1.7 总结

第2章 引言

2.1 研究目的和意义

2.2 研究范围和内容

第3章 实验材料与方法

3.1 实验材料与仪器

3.1.1 实验动物

3.1.2 实验主要试剂

3.1.3 实验仪器

3.2 实验方法

3.2.1 试剂配制

3.2.2 细胞培养

3.2.3 人外周血单核细胞获取

3.2.4 小鼠腹腔巨噬细胞获取

3.2.5 ELISA检测细胞因子IL-6和TNF-α

3.2.6 CCK-8检测CpG-ODN对RAW264.7细胞的毒性

3.2.7 划痕实验

3.2.8 细菌培养

3.2.9 细菌DNA提取(革兰氏阴性菌)

3.2.10 Real-time PCR

3.2.11 琼脂糖凝胶电泳实验

3.2.12 生物信息学分析

3.2.13 统计分析

第4章 结果与分析

4.1 CpG-ODN数量水平和分布规律

4.2 天然的强免疫刺激性CpG-ODN的发现及其相关免疫属性

4.2.1 强免疫刺激性CpG-ODNs的筛选

4.2.2 CpG-c41抑制CpG-ODNs诱导炎症因子TNF-α和IL-6的释放

4.2.3 免疫刺激性CpG-ODNs细胞毒性的研究

4.2.4 免疫刺激性CpG-ODNs对细胞迁移能力的影响

4.2.5 CpG-ODNs 免疫刺激分布情况

4.3 CpG-ODNs保守性分析

4.4 CpG-ODNs在细菌基因组中拷贝数分析

4.4.1 CpG-ODNs在细菌基因组中拷贝数统计

4.4.2 CpG-ODNs在E. coli基因组中真实拷贝数的验证

4.5 CpG-ODN特征结构与其免疫刺激性之间的关系

4.5.1 活性motif与CpG-ODN免疫刺激性的关系

4.5.2 CpG 基序的位置与CpG-ODN免疫刺激性之间的关系

4.5.3 CpG 基序数与CpG-ODN免疫刺激性之间的关系

第5章 讨论

参考文献

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