家鹅细胞色素b基因序列进化研究

摘要

测定了中国家鹅15个品种、欧洲鹅2个品种共44个个体的细胞色素b基因全序列(1 143 bp),与GenBank中白额雁细胞色素b基因序列合并在一起比对分析,结果表明:全序列中没有缺失、插入或移码突变,转换数(Ts)明显高于颠换数(Tv),密码子第3位点呈现了相当强烈的转换偏倚性;密码子第1位点的替换速率变异最大;同义密码子表现出一定程度的使用偏倚性;dS与dN值间的差异极显著(Z=4.713,P＜0.01),而ω(dS/dN)=0.028 4,明显小于0.3,表明雁属鹅细胞色素b基因序列经历了中度净化选择作用;单步非同义替换分布模式与Grantharm'距离之间的关系说明密码子的3个位点所受的净化选择强度不同,第2位点的净化选择作用强度最大(Granthem距离为204).