罗伊氏乳杆菌对仔猪空肠miRNAs表达谱的影响

摘要

试验旨在研究罗伊氏乳杆菌对仔猪空肠miRNAs表达的影响.选用1日龄健康约克×荣昌仔猪6窝,随机分为两组,每组3窝(共27头).即对照组(每天每头灌喂0.1％的无菌蛋白胨溶液),LR组(每天每头灌喂活菌总数为1.0×1010CFU的罗伊氏乳杆菌),分别在10和20日龄,每组选取6头进行屠宰,采集空肠样品.通过Sol-exa高通量测序技术检测空肠miRNA的表达谱,利用生物信息学技术进行靶基因预测和功能分析.结果 显示:1)试验构建了8个文库,共获得187 103 840条纯净reads序列,其中22 nt长度序列占的比例最大;2)10和20日龄分别鉴定出354和352个已知的miRNAs,其中有329个miRNAs共表达;3)灌喂罗伊氏乳杆菌组仔猪空肠miRNA差异表达,10和20日龄分别获得7和9个差异显著的miRNAs,ssc-miR 218在两个日龄中都差异表达;4)对差异表达的miRNAs进行靶基因预测和KEGG通路分析,发现有10 221个靶基因富集到293条通路上,有66条通路显著富集(P＜0.05),包括与肠道发育及免疫调控相关的MAPK和PI3K-Akt信号通路;5)随机挑选6个差异表达miRNAs进行荧光定量PCR验证,验证结果与测序结果基本一致.本研究表明,罗伊氏乳杆菌可能通过影响空肠miRNAs表达来调控有关肠道健康的信号通路.