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侵染葱鳞葡萄孢的一种新型dsRNA病毒

         

摘要

测定了葱鳞葡萄孢(Botrytissquamosa)菌株LeekBc-10和GarlicBc-2的菌丝生长速度、致病力和菌株LeekBc-10中一种dsRNA病毒的eDNA序列及其推定编码的蛋白质序列,并对该病毒进行了系统进化分析。结果表明:菌株OarlicBc-2菌丝生长较快、致病力较强,菌株LeekBc-10菌丝生长较慢、致病力较弱。菌株Leek-Bc-10菌丝中有2条dsRNA片段(dsRNA-1和dsRNAu2),序列测定表明:dsRNA-1和dsRNA-2核苷酸序列与相对应BotrytisporriRNAvirus1(BpRV1)中2条dsRNA片段的相似性分别为91.7%和97.7%,故可判断菌株LeekBc-10中的dsRNA是一种真菌病毒,暂时命名为BotrytissquareosaRNAvirus1(BsRV1)。BsRV1中dsRNA-1和dsRNA-2分别含有一个大的开放阅读框(ORF),即ORFⅠ和ORFⅡ,各自编码长度为1901和1788个氨基酸的假定蛋白,且分别与BpRV1中的对应假定蛋白的相似度为97.1%和98.7%。对BsRVlORFl编码的假定蛋白的分析表明:该蛋白含有RdRp-4(RNAdependemRNApolymerase)超家族蛋白的保守结构域。BsRVl的RdRp与Totiviridae、Chrysoviridae和Megabirnaviridae等科病毒的RdRp同源性为19%~23%,且具有上述病毒RdRp的8个保守结构域。系统发育分析表明:BsRVl与BpRVl聚在一起形成一个独立分支,属于同一种病毒,且不能归到任何已有的病毒科中,因而可能代表一个新的病毒科。

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