花生NPR1基因密码子偏好性研究

摘要

NPR1基因是植物免疫调控的重要交叉点,是调节植物整体抗病网络的重要因子.本文通过RACE技术获得7种花生栽培种和9种花生野生种NPR1基因cDNA全长序列,应用CodonW软件进行了密码子偏好性分析,并与大豆、拟南芥、水稻和玉米NPR1基因cDNA序列进行密码子偏好性比较.对花生NPR1基因密码子组成、有效密码子数、同义密码子相对使用度、密码子适应指数等各项参数进行统计分析发现,NPR1基因在花生中有明显的偏好性,特别偏好使用以A或T结尾的密码子,且与单子叶植物水稻和玉米的密码子偏好性有较大差异.有效密码子数与编码同义密码子第3位的GC含量呈显著正相关.研究该基因密码子的使用模式,为基因工程手段改良花生品种提供理论支持.