亚洲棉

摘要： 为了探究CBL(钙调磷酸酶B亚基蛋白)基因参与棉花非生物胁迫响应。利用生物信息学的方法对亚洲棉CBL家族成员进行鉴定,并对其成员的理化性质、进化关系、基因结构、蛋白结构、染色体定位、顺式作用元件进行分析。结果表明,在亚洲棉中获得20个CBL基因,该基因成员蛋白的理化性质差异不大,大多数CBL基因成员的等电点为4~5.5,CBL蛋白中的氨基酸大部分为酸性;系统进化树分析得出两个组,Group II包含的成员最多,Group I中仅有GaCBL4-1、GaCBL4-2、GaCBL4-3和GaCBL8共4个成员;结构域和保守基序分析发现所有的CBL基因均含有至少一个EF-hand结构域,且同一类群中的大多数成员具有相似的motif;基因结构分析发现同一类群中外显子-内含子结构比较相似,不同组之间的基因结构差异较大。染色体定位分析发现18个CBL基因被定位在10条染色体上,而GaCBL2-5和GaCBL2-6不能定位到任何染色体上。GaCBL家族基因成员启动子区域中均含有多个能够应答逆境和植物激素的顺式作用元件。综上表明,亚洲棉各CBL基因参与不同的生物学过程并发挥着不同的功能。

摘要： 棉花是世界上最重要的经济作物之一,棉花胚珠表皮细胞特化形成的超长表皮毛即为棉纤维[1,2].棉纤维是人类用以遮身蔽体、御寒保暖的衣物之源.棉花属于锦葵科棉属,共有4个栽培种,即陆地棉(Gossypium hisutum)、海岛棉(Gossypium barbadence)、亚洲棉(Gossypium arboreum)和草棉(Gossypium herbaceum).具有AADD异源四倍体基因组的陆地棉是世界上栽培面积最广的品种.陆地棉的A二倍体基因组起源于草棉(A1)和亚洲棉(A2)的共同祖先A0(已灭绝)[3].草棉和亚洲棉具有的基因组和功能基因的特性,是陆地棉性状的重要遗传基础.

摘要： 为了探究CBL(钙调磷酸酶B亚基蛋白)基因参与棉花非生物胁迫响应.利用生物信息学的方法对亚洲棉CBL家族成员进行鉴定,并对其成员的理化性质、进化关系、基因结构、蛋白结构、染色体定位、顺式作用元件进行分析.结果表明,在亚洲棉中获得20个CBL基因,该基因成员蛋白的理化性质差异不大,大多数CBL基因成员的等电点为4～5.5,CBL蛋白中的氨基酸大部分为酸性;系统进化树分析得出两个组,GroupⅡ包含的成员最多,Group I中仅有GaCBL4-1、GaCBL4-2、GaCBL4-3和GaCBL8共4个成员;结构域和保守基序分析发现所有的CBL基因均含有至少一个EF-hand结构域,且同一类群中的大多数成员具有相似的motif;基因结构分析发现同一类群中外显子-内含子结构比较相似,不同组之间的基因结构差异较大.染色体定位分析发现18个CBL基因被定位在10条染色体上,而GaCBL2-5和GaCBL2-6不能定位到任何染色体上.GaCBL家族基因成员启动子区域中均含有多个能够应答逆境和植物激素的顺式作用元件.综上表明,亚洲棉各CBL基因参与不同的生物学过程并发挥着不同的功能.

摘要： 棉花,锦葵科棉属植物,英文名cotton。棉花其实不是“花”,而是花凋谢后的果实一一棉桃(也叫棉铃)里保护种子的絮状纤维。这种絮状纤维,经过简单加工后即可纺纱织布,是世界上最重要的纺织原料之一。野生棉种类繁多,不过其中只有四个种被人类长期选择、驯化和栽培,它们是:亚洲棉(G.arboreum)、非洲棉(G.herbaceum)、陆地棉(G.hirsutum)和海岛棉(G.barbadense)。

摘要： 以亚洲棉为母本,野生种拟似棉为父本进行远缘杂交,人工辅助授粉合成杂种F1,验证F1杂种的真实性,以期进一步加倍成异源四倍体新种质.采用重复授粉和赤霉素保铃等措施提高杂交结铃率,对F1进行形态学及SSR分子标记鉴定.结果表明,F1杂种有典型的合子后生殖隔离现象,植株培养过程中伴随有杂种致死,F1杂种幼苗叶型大部分介于双亲之间且整体偏向于父本拟似棉;SSR分子标记结果显示杂种F1不仅扩增出双亲的互补带,还出现了双亲没有的新带;经过统计分析发现杂种F1中总的遗传成分比例母本占45.91％,父本占40.98％,新出现的组合带占13.11％.从分子水平证明了杂种的真实性,同时伴随的杂交过程也发生了AD基因组互作及遗传重组.

摘要： PP2C是一大类重要的蛋白磷酸酶,广泛参与不同的逆境胁迫响应.为了解PP2C基因在干旱响应中的功能,以亚洲棉石系亚1号为材料,利用RT-PCR方法从中克隆了GaPP2C24基因,并对该基因进行了生物信息学分析,荧光定量PCR研究了其在亚洲棉不同组织和干旱胁迫下的表达情况.结果表明,GaPP2C24基因CDS序列全长为1251 bp,编码416个氨基酸.序列同源比对发现,GaPP2C24与其他植物的PP2C氨基酸序列有较高的相似性,其中与可可树(EOY33930.1)、黄麻(OMO91132.1)的相似性分别为85％,84％.进化分析表明,GaPP2C24与同属锦葵目的黄麻聚在一支,亲缘关系最近,与可可树的亲缘关系次之.实时荧光定量PCR结果表明,GaPP2C24基因在子叶、下胚轴、胚根、叶、茎和根均有表达,且在茎中的表达量最高,根中次之.GaPP2C24受干旱胁迫的诱导表达,其在根和叶片中的相对表达量在处理1 h后最高,分别达到对照的53.9,6.9倍,推测该基因在棉花干旱响应中有重要作用.

摘要： 国际期刊《植物生物技术》(Plant Biotechnology Journal)发表了中国农业科学院棉花研究所最新成果,发现亚洲棉中无蜜腺性状在中国的传播演化过程中受到强烈的选择。

摘要： 在本研究中，使用了基于同源搜索的最先进的比较基因组学方法，在亚洲棉栽培种内鉴定出了73个miRNAs，包含在miRNA49个家族中。采用实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR），验证了几个预期的miRNAs。这些miRNA的长度为18-22个核苷酸大小，平均长度为20个核苷酸。miRNA前体的长度在46-684个核苷酸范围内，平均长度为1386120个核苷酸。对于大多数亚洲棉miRNAs，每一个家族只有一个miRNA。尽管如此，我们已经鉴定出了大量miRNAs，分别属于miRNA156,414,837,838,1044,1533,2902,2868,5021和5142家族。在亚洲棉miRNA前体中，核苷酸A和U占比例最大，达到62. 95%。亚洲棉miRNA前体具有较高的负相关最小折叠自由能(MFE)、校正最小折叠自由能(AMFE)和较高的最小折叠自由能系数(MFEI)。在亚洲棉中鉴定出了大量的miRNAs，表明在二倍体棉花生长发育过程中，同陆地棉一样，miRNA也起了同样的调控作用。

摘要： 本发明公开了一种利用KASP标记鉴定亚洲棉的花基红斑性状的方法。所述方法包括以下步骤：步骤1，提取亚洲棉基因组DNA；步骤2，开发亚洲棉花基红斑KASP标记；步骤3，KASP基因分型，KASP‑PCR反应在Douglas Array Tape平台上进行；步骤4，KASP分子标记判定花基红斑性状。本发明所述方法的每个KASP标记判定准确率在92％以上，5个KASP标记同时进行判定，判定效率在96％以上。可达到早期鉴定花基颜色的目的。

摘要： 本发明属于棉花分子生物学、基因工程技术领域，尤其涉及一种控制亚洲棉光籽性状基因及其编码的蛋白质以及应用，所述基因命名为GaFZ，该基因仅有一个外显子无内含子，长度为264 bp，所述基因和编码蛋白的核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1所示，通过解析该基因的分子生物学功能，探究其对表皮毛和棉纤维发育的分子机制，进而利用该基因提高棉纤维产量，培育环境友好型棉花品种。

摘要： 本发明属于生物技术领域，提出了一种miR164a在应答亚洲棉耐盐中的应用，miR164a及前体基因它来自于亚洲棉品种Shixiya1，将前体基因插入经改造的棉花叶皱缩病毒(CLCrV)沉默载体系统中，获得亚洲棉CLCrV:miR164a重组表达载体，将重组表达载体转化到农杆菌菌株GV3101中，转染亚洲棉。实验结果表明miR164a负调节棉花对盐的胁迫应答，通过调控植株中miR164a的表达量，可以调控植株应答盐胁迫的能力，从而提高植株抗性。

摘要： 本发明公开了一种亚洲棉miR172c在调控目的植物应答盐胁迫中的应用，可通过调节该miRNA表达量以调控目的植物应答盐胁迫的能力。实验证明，300mM NaCl溶液浇灌营养土之后光照16h，黑暗8h，交替浸泡48h后，亚洲棉过表达植株CLCrV:miR172c的叶片出现萎蔫。进一步测量叶片电导率，结果显示亚洲棉过表达植株CLCrV:miR172c叶片相对电导率显著升高。说明miR172c负调节棉花对盐的胁迫应答，因此可以通过调控植株中miR172c的表达量，调控植株应答盐胁迫的能力，从而提高植株抗性。本发明为调控目的植物应答盐胁迫的能力提供了一种新的途径，在农业领域具有广阔的应用空间和市场前景。

摘要： 本发明公开了与亚洲棉DPL972纯合光籽性状紧密连锁的分子标记，分子标记有三个，位于8号染色体A08上，分别为命名为分子标记971SV6、分子标记SV6F12R和分子标记SV25LUC，其中分子标记971SV6的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，分子标记SV6F12R的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，分子标记SV25LUC的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。本发明找到了鉴定亚洲棉光籽材料的分子标记。可用于纯合光籽性状的分子标记辅助选择以及光籽基因精细定位和图位克隆，为棉花纤维起始研究、纤维品质改良以及棉花遗传育种提供一定的理论依据。

摘要： 本发明公开了一种与亚洲棉DPL972光籽性状紧密连锁的分子标记及应用，该分子标记位于6号染色体A08上，该分子标记正向引物序列如SEQ ID No.1所示，反向引物序列如SEQ ID No.2所示。本发明找到了鉴定亚洲棉光籽材料的一对引物。在亚洲棉自然群体中能解释80‑90％的表型变异。可用于光籽性状的分子标记辅助选择以及光籽基因精细定位和图位克隆，为棉花纤维起始研究、纤维品质改良以及棉花遗传育种提供一定的理论依据。

摘要： 本发明公开了一种亚洲棉原生质体分离与外源基因转化的方法。该方法包括亚洲棉种子萌发、酶解分离原生质体、离心收集原生质体、培养、外源基因转化及显微观察鉴定等步骤。本发明黑暗环境中生长的叶片所分离的原生质体浓度符合实验需求且完整度高，可得到完整的转化成功的原生质体。因此本发明得出的利用黑暗环境培养的叶片分离原生质体方法，更好地解决了亚洲棉原生质体分离及外源基因转化的难题。亚洲棉原生质体分离及外源基因成功转化，可为开展亚洲棉大规模细胞培养、有目的地导入外源基因及进一步创新和品质改良工作提供基础帮助。

摘要： 本发明公开了一种利用KASP标记鉴定亚洲棉的花基红斑性状的方法。所述方法包括以下步骤：步骤1，提取亚洲棉基因组DNA；步骤2，开发亚洲棉花基红斑KASP标记；步骤3，KASP基因分型，KASP‑PCR反应在Douglas Array Tape平台上进行；步骤4，KASP分子标记判定花基红斑性状。本发明所述方法的每个KASP标记判定准确率在92％以上，5个KASP标记同时进行判定，判定效率在96％以上。可达到早期鉴定花基颜色的目的。

摘要： 本发明涉及一种用于单细胞转录组测序的亚洲棉根尖细胞与叶肉细胞原生质体的解离方法，该方法包括亚洲棉种子的萌发、组织培养、酶解解离原生质体、离心收集原生质体以及显微观察鉴定等步骤。本发明从亚洲棉的根尖和叶片所解离的原生质体浓度较高(高于3000cells/μL)，且活率不低于92％，完全符合10×Genomics单细胞转录组测序的上机要求。因此本发明得出的根尖与叶片解离原生质体的方法，更好的解决了亚洲棉根尖细胞与叶肉细胞原生质体解离困难以及活率低的难题，从而可以更好的研究棉花抗逆过程特定基因的表达，对于棉花的遗传发育与培育抗逆棉花的品种至关重要。

摘要： 本发明公开了一种亚洲棉miR172c在调控目的植物应答盐胁迫中的应用，可通过调节该miRNA表达量以调控目的植物应答盐胁迫的能力。实验证明，300mM NaCl溶液浇灌营养土之后光照16h，黑暗8h，交替浸泡48h后，亚洲棉过表达植株CLCrV:miR172c的叶片出现萎蔫。进一步测量叶片电导率，结果显示亚洲棉过表达植株CLCrV:miR172c叶片相对电导率显著升高。说明miR172c负调节棉花对盐的胁迫应答，因此可以通过调控植株中miR172c的表达量，调控植株应答盐胁迫的能力，从而提高植株抗性。本发明为调控目的植物应答盐胁迫的能力提供了一种新的途径，在农业领域具有广阔的应用空间和市场前景。